Seqstant

Metagenomische Diagnostik per Next-Generation Sequencing (NGS) liefert eine vollständige Erregerlandschaft aus einer einzigen klinischen Probe – von Bakterien über Viren bis zu Resistenzgenen. Wer dieses Verfahren bisher einsetzen wollte, brauchte teure bioinformatische Infrastruktur und spezialisiertes Fachpersonal im Labor. Das 2021 aus dem Hasso-Plattner-Institut (HPI) in Potsdam ausgegründete Unternehmen Seqstant GmbH mit Sitz in Teltow bei Berlin hat mit LiveGene eine Softwareplattform entwickelt, die den gesamten Analyseprozess automatisiert und als Algorithm-as-a-Service ohne eigene Recheninfrastruktur nutzbar macht. Die Plattform richtet sich an klinische Labore, Krankenhäuser und Labordienstleister, die NGS-gestützte Infektionsdiagnostik ohne Aufbau eigener Bioinformatik-Kapazitäten einsetzen wollen.

Wie funktioniert's

Der LiveGene-Workflow besteht aus drei aufeinander abgestimmten Komponenten. Ein patentierter Sequenzier-Adapter bereitet klinische Proben für die NGS-Analyse vor. Ein DSGVO-konformer Data Uploader überträgt die Rohdaten anonymisiert und sicher in die Cloud. Ein bioinformatischer Algorithmus identifiziert anschließend Erreger, Resistenzgene und Qualitätsmetriken in Echtzeit. Laut Angaben des Unternehmens (seqstant.com, Mai 2026) liegen erste Befunde bereits nach vier Stunden vor – weit früher als bei klassischen Kulturverfahren, die je nach Erreger 24 bis 72 Stunden benötigen. Für die behandelnde Klinik bedeutet das: Antibiotikaentscheidungen können auf Basis eines vollständigen Resistenzprofils getroffen werden, statt mit empirischen Breitspektrum-Therapien zu beginnen. Die Befunde erscheinen im LiveGene Analysis Portal und lassen sich über Standardschnittstellen in bestehende Labor- und Klinik-IT-Systeme integrieren. Der Dienst läuft vollständig als Cloud-Service und erfordert keinen Betrieb eigener Serverinfrastruktur.

Wer steckt dahinter

Seqstant wurde von Dr. Henri Knobloch und Dr. Tobias Loka gegründet. Knobloch ist promovierter Biomedical Scientist mit Erfahrung im Gesundheits-IT-Management; Loka als promovierter Bioinformatiker entwickelte die algorithmischen Grundlagen für die Echtzeit-NGS-Auswertung bereits am HPI. Das Hasso-Plattner-Institut in Potsdam ist ein führendes deutsches Informatik-Forschungsinstitut mit Sitz auf dem Potsdamer Uni-Campus, das regelmäßig Technologieunternehmen im Digital-Health-Bereich ausgründet. LiveGene ist nach ISO 13485 zertifiziert – dem internationalen Qualitätsmanagementsystem für Medizinprodukte, auditiert durch unabhängige Zertifizierungsstellen – und trägt die IVDR CE-Kennzeichnung nach EU-IVD-Verordnung 2017/746. Diese Zulassung ist Pflichtvoraussetzung für den regulatorisch konformen Einsatz in der zertifizierten Infektionsdiagnostik in EU-Kliniken.

Für wen ist es gedacht

Primäre Zielgruppen sind klinische Labore und Krankenhäuser, die NGS-basierte Erregerdiagnostik einsetzen wollen, ohne eigene Bioinformatik-Kapazitäten aufzubauen. Labordienstleister profitieren von Hochdurchsatz und Skalierbarkeit des Cloud-Dienstes. Kliniken erhoffen sich durch schnellere Diagnose kürzere Liegezeiten und eine präzisere Antibiotika-Steuerung, die zur Reduktion von Resistenzentwicklungen beiträgt. Die IT-Abteilungen werden durch den Ende-zu-Ende-Service entlastet, da kein Aufbau oder Betrieb eigener Serverinfrastruktur erforderlich ist. Neben dem klinischen Einsatz adressiert LiveGene auch die Umweltanalytik, wo schnelle Erregerdetektion etwa beim Ausbruchs-Monitoring besonders relevant wird.